Средний диаметр овального окна составляет 5 мм, что достаточно для прохождения тромботических сгустков — эмболов, способных закрыть мозговые артерии вызвав ишемический инсульт.
При первом вдохе давления правом предсердии уменьшается из-за падения сопротивления в малом круге этом первичная перегородка прижимается к второй перегородке, закрывая овальное окно.
Овальное окно представляет собой короткий канал между двумя камерами сердца- предсердиями (средняя длина 5), расположенный точно по кровотока, поступающего из нижней полой вены.